２００１年“９·１１”事件发生后，各国普遍加强航空安全，但世界各地仍发生多起重大劫机事件。

    ２００２年２月２０日，“哥伦比亚革命武装力量”游击队组织成员在哥伦比亚乌伊拉省劫持一架小型客机。他们在地面同伙的烟柱导引下，迫使飞行员将飞机降落在距首都波哥大以南２７０公里处的高速公路上。随后，劫机者将乘客赶下飞机，并将其中３名乘客绑架。７名劫机者同年３月落网。

    ５月１１日，伊朗南部城市克尔曼至首都德黑兰的航班发生劫机案，一名４５岁男子身系两枚自制炸弹，在衣服上洒满酒精，手持打火机，企图闯入驾驶舱内，并扬言要将飞机炸毁。飞机上的伊朗革命卫队便衣警察在他闯入驾驶舱前将其制伏。

    １１月１７日，以色列航空公司一架从特拉维夫飞往土耳其伊斯坦布尔的班机在飞行途中发生劫机事件。一名男子用刀向女乘务员发动袭击，还试图持刀闯入驾驶舱。飞机上的安全警卫在乘客帮助下将其制服。飞机最后在伊斯坦布尔机场降落。机上共有约１７０名乘客。

    ２００３年１月５日，一名武装男子在德国法兰克福巴本豪森机场劫持一架双座轻型飞机，扬言要撞击在法兰克福的欧洲中央银行大楼，但最终没有采取行动。飞机在空中盘旋了约两个小时后安全降落，劫机者被警方当场拘捕。这名劫机者曾告诉当地电视台，他劫持飞机的目的是为了引起人们对其偶像、美国犹太人女宇航员朱迪思·雷斯尼克的注意。１９８６年，朱迪思·雷斯尼克乘坐的“挑战者”号航天飞机在发射后不久爆炸。

    ２月７日，一架从土耳其安卡拉起飞的Ａ－３１０客机在伊斯坦布尔降落后，一名２８岁的男乘客声称身上有炸弹，将两名乘务员劫为人质。土耳其警方接到报警后，迅速包围了客机。在歹徒劫机前，乘客已经离机。防暴警察冲进客机制服了歹徒，没有造成人员伤亡。警方后来发现，歹徒身上根本没有炸弹，只是把一些蜡烛捆绑成炸药雷管的样子。

    ３月１９日，一架自古巴青年岛飞往首都哈瓦那的ＤＣ－３型飞机遭６人劫持，降落在美国佛罗里达州韦索岛的国际机场。机上有包括劫机犯在内的３１名乘客，５名机组人员和一名保安人员。劫机犯在向美国警方投降后被关押受审。

    ３月３１日，古巴一架载有４６人的安－２４飞机从古巴青年岛首府新赫罗纳飞往哈瓦那途中，被一名自称携带两枚手榴弹的男子劫持。劫机者要求飞机改道飞往美国，但由于油料不足，飞机被迫降落在哈瓦那机场。在哈瓦那机场停留一晚后，劫机分子分两批释放了部分乘客，然后强迫飞机加油后飞往美国佛罗里达。劫机者随后向美警方投降。

    ８月１９日，一名５５岁的男子劫持一架阿尔及利亚航空公司的波音７３７客机，这架飞机从首都阿尔及尔起飞，中途经过阿西北重镇奥兰，然后飞往法国里尔市。飞机起飞后不久，这名男子威胁机组人员说自己携带的盒子中装有一枚炸弹，要求飞机改变航线飞向瑞士日内瓦。在机组人员的劝说下，他同意飞机在奥兰降落加油并释放所有乘客。当飞机在奥兰机场降落后，这名劫机者主动离开飞机向当局投降。

    ２００５年８月２７日，一架利比亚Ｃ－１３０运输机在运送被利比亚当局驱逐的７６名厄立特里亚公民前往埃塞俄比亚首都亚的斯亚贝巴途中，在苏丹领空遭到劫持后迫降喀土穆机场。劫机者提出了与联合国驻苏丹代表进行会晤的要求。但在联合国官员前往机场途中，劫机者突然要求飞机驾驶员驾机起飞。飞机在喀土穆上空盘旋了４０分钟，苏丹当局不得不关闭喀土穆机场。苏丹官员在与劫机者取得联系后，劝说他们同意飞机再次降落在喀土穆机场。飞机降落后，苏丹安全部队立即包围了飞机。劫机者随后向苏丹安全部队投降。

    ９月１２日，哥伦比亚“艾雷斯”航空公司的一架小型客机从哥南部城市弗洛伦西亚飞往西南部城市内瓦途中遭到劫持，迫降波哥大。经过数小时谈判，两名劫机者走出飞机，登上一辆消防车离开机场。

    ２００６年１０月３日，土耳其航空公司一架波音７３７型客机从阿尔巴尼亚首都地拉那飞往土耳其伊斯坦布尔途中遭劫持，后在意大利战机的迫使下降落在意大利南部的布林迪西机场。两小时后，劫机者向当地警方投降。