2005年4月，王玉清被任命为副院长后分管民事审判工作。她总结自己多年的民事审判经验，创造出了颇具特色的调解六法，收到了明显成效。仅半年，滑县法院民事案件的调解率就上升了7个百分点，达到了70%。

　　2006年5月9日，滑县法院开庭审理杨志彦诉滑县线材厂破产清算组侵权纠纷一案，王玉清担任审判长。案情复杂，庭审持续了三个多小时。由于身体状况的原因，王玉清的脸色煞白。庭审中，她从衣兜里摸出大把的药片吞服，即使这样，她仍然一丝不苟地完成了庭审。没有人知道，这次开庭距她第三次手术结束还不到一个星期。

　　早在2001年8月中旬，王玉清在法院干警身体健康普查中就被查出患有子宫肿瘤，可她每天依然早出晚归，忙于办案。2002年2月21日，王玉清的爱人发现她痛苦难忍，强迫她到安阳市肿瘤医院检查。经肿瘤切片检查后，医生告诉她，肿瘤已经增大许多，如不及时手术，后果很严重。2月24日，王玉清动了第一次肿瘤切除手术。手术后不到半个月，她回到了工作岗位。一上班，她就要求身边的同志“注意保密”。每月5天的治疗，她也是趁着休息日赶到医院，为的就是不耽误工作。不久，王玉清在一次检查中，被发现病情恶化，专家经会诊认为，肿瘤为低度恶性肿瘤，必须进行第二次手术，否则将有生命危险。2002年6月7日，王玉清做了第二次手术，术后，医生又一次严肃地告诫她，必须注意休息、注意治疗，确保五年之内病情不加重、不复发，否则后果不堪设想。然而，一个月后，她就又重新出现在办公室里，坐在了审判长的席位上，不但亲自担任审判长审理重大疑难案件，而且把大部分时间都用到下基层指导法庭工作上来。在她的指导下，人民法庭的民事案件调解率都在85%以上，民事案件简易程序适用率也达85%以上，结案周期由过去的3个月缩短为2个月，审理的民事案件无一超审限。

　　2006年4月下旬，过度劳累的她又感到了身体不适，经复检，下肢淋巴结肿大，必须马上手术。手术结束后，王玉清只输了几天液，便带着药又返回了工作岗位。

　　看着窗外明媚的阳光，王玉清轻声地说：“如果有来生，我还做法官。”