1982年

    １９８１年，国务院的工作部门有１００个，达到建国以来的最高峰。臃肿的管理机构已不能适应改革开放和经济社会发展的需要，亟待改革。

    １９８２年３月８日，五届全国人大常委会第二十二次会议通过了关于国务院机构改革问题的决议。这次改革明确规定了各级各部的职数、年龄和文化结构，减少了副职，提高了素质；在精简机构方面，国务院各部门从１００个减为６１个，人员编制从原来的５．１万人减为３万人。

    1988年  

    １９８８年４月９日，七届全国人大一次会议通过了国务院机构改革方案，启动了新一轮的机构改革。

    这次改革着重于大力推进政府职能的转变。政府的经济管理部门要从直接管理为主转变为间接管理为主，强化宏观管理职能，淡化微观管理职能。其内容主要是合理配置职能，科学划分职责分工，调整机构设置，转变职能，改变工作方式，提高行政效率，完善运行机制，加速行政立法。改革的重点是那些与经济体制改革关系密切的经济管理部门。改革采取了自上而下，先中央政府后地方政府，分步实施的方式进行。

    通过改革，国务院部委由原有的４５个减为４１个，直属机构从２２个减为１９个，非常设机构从７５个减到４４个。在国务院６６个部、委、局中，有３２个部门共减少１．５万多人，有３０个部门共增加５３００人，增减相抵，机构改革后的国务院人员编制比原来减少了９７００多人。

    1993年

    １９９３年３月２２日，第八届全国人大一次会议审议通过了关于国务院机构改革方案的决定。方案实施后，国务院组成部门、直属机构从原有的８６个减少到共５９个，人员减少２０％。１９９３年４月，国务院决定将国务院的直属机构由１９个调整为１３个，办事机构由９个调整为５个。国务院不再设置部委归口管理的国家局，国务院直属事业单位调整为８个。此外，国务院还设置了国务院台湾事务办公室与国务院新闻办公室。

    1998年

    １９９８年３月１０日，九届全国人大一次会议审议通过了关于国务院机构改革方案的决定。改革的目标是：建立办事高效、运转协调、行为规范的政府行政管理体系，完善国家公务员制度，建设高素质的专业化行政管理队伍，逐步建立适应社会主义市场经济体制的有中国特色的政府行政管理体制。

    根据改革方案，国务院不再保留的有１５个部、委。新组建的有４个部、委。更名的有３个部、委。改革后除国务院办公厅外，国务院组成部门由原有的４０个减少到２９个。

    从１９９８年开始，国务院机构改革首先进行，随后中共中央各部门和其它国家机关及群众团体的机构改革陆续展开；１９９９年以后，省级政府和党委的机构改革分别展开；２０００年，市县乡机构改革全面启动。截至２００２年６月，经过四年半的机构改革，全国各级党政群机关共精简行政编制１１５万人。

    2003年

    ２００３年３月１０日，十届全国人大一次会议第三次全体会议以绝对多数通过了关于国务院机构改革方案的决定。方案特别提出了“决策、执行、监督”三权相协调的要求。除国务院办公厅外，国务院２９个组成部门经过改革调整为２８个，不再保留国家经贸委和外经贸部，其职能并入新组建的商务部。

    根据方案，国家发展计划委员会改组为国家发展和改革委员会，其任务是研究拟订经济和社会发展政策，进行总量平衡，指导总体经济体制改革。

    国家药品监督管理局重组为国家食品药品监督管理局，原属于国家经贸委管理的国家安全生产监督管理局改为国务院直属机构。同时，将国家计划生育委员会更名为国家人口和计划生育委员会。设立国务院国有资产监督管理委员会（简称“国资委”），以指导推进国有企业改革和重组；设立中国银行业监督管理委员会（简称“银监会”），以加强金融监管，确保金融机构安全、稳健、高效运行。